Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21060J3KMU4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21060J3KMU4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms