Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm20830J3KML6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Gm20830J3KML6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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