Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp408H7BX78 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp408H7BX78 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp408H7BX78 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp408H7BX78 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp408H7BX78 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp408H7BX78 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp408H7BX78 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp408H7BX78 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zfp408H7BX78 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms