Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm29394H3BIW7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm29394H3BIW7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms