Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcf11G3X9Z4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcf11G3X9Z4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms