Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arfgef1G3X9K3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgef1G3X9K3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms