Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
2610008E11RikG3X964 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms