Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r39G3UWE6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r39G3UWE6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms