Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ercc6F8VPZ5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ercc6F8VPZ5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms