Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Speer4aF8VPX6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Speer4aF8VPX6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms