Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Farp1F8VPU2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms