Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm5160F8VPN3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms