Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm3371F7CQW8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm3371F7CQW8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms