Protein–RNA interactions for Protein: F6ZZG8

Gm5624, Predicted gene 5624 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5624F6ZZG8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm5624F6ZZG8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms