Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Syngap1F6SEU4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms