Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Raph1F2Z3U3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Raph1F2Z3U3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms