Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd7E9Q9W7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd7E9Q9W7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms