Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf169E9Q7F2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms