Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm20518E9Q548 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm20518E9Q548 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Gm20518E9Q548 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm20518E9Q548 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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