Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17175E9Q528 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm17175E9Q528 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm17175E9Q528 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm17175E9Q528 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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