Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NbasE9Q411 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NbasE9Q411 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms