Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r238E9Q373 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms