Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms