Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NebE9Q1W3 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms