Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt78E9Q0F0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms