Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gcom1E9PZ54 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gcom1E9PZ54 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms