Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm3298E9PW80 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm3298E9PW80 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3298E9PW80 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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