Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm8994E9PV04 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms