Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp839E9PUU5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms