Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klhl3E0CZ16 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms