Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defa28D3Z1V9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa28D3Z1V9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms