Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc6D3YZP9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc6D3YZP9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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