Protein–RNA interactions for Protein: D3YYY1

Scgb2b7, ABPBG7, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b7D3YYY1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scgb2b7D3YYY1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scgb2b7D3YYY1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms