Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rnf217D3YYI7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf217D3YYI7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms