Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Samd1D3YXK1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms