Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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BC048679D3YXE9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
BC048679D3YXE9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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