Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gm4950D3YUM8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm4950D3YUM8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms