Protein–RNA interactions for Protein: D3YU81

Rfx8, DNA-binding protein RFX8, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx8D3YU81 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Rfx8D3YU81 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rfx8D3YU81 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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