Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Kpna7C0LLJ0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Kpna7C0LLJ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms