Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pdzd8B9EJ80 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms