Protein–RNA interactions for Protein: B7ZMY3

A930018M24Rik, RIKEN cDNA A930018M24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A930018M24RikB7ZMY3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A930018M24RikB7ZMY3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms