Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apol6B7ZC55 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apol6B7ZC55 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms