Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ppfia1B2RXQ2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms