Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cfap58B2RW38 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms