Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rd3lB2RV38 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rd3lB2RV38 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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