Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PtprbB2RU80 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PtprbB2RU80 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PtprbB2RU80 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtprbB2RU80 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PtprbB2RU80 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PtprbB2RU80 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PtprbB2RU80 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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