Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt4B2RU40 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt4B2RU40 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms