Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rrn3B2RS91 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms