Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Brpf1B2RRD7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms