Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp42B2RQC2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp42B2RQC2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms